סוגיית ההפרדה היא גם אחת הסוגיות המורכבות בשיח הציבורי והיא עולה חדשות לבקרים בכל תחומי החיים, ממופעי בידור ועד אוטובוסים. ייחודית היא סוגיית ההפרדה באקדמיה.
האקדמיה הישראלית היא במהותה מרחב ליברלי, וככזו נושא ההפרדה בין המינים זר לה. עם זאת לצורך שילוב חרדים בשדרות ההשכלה והתעסוקה בישראל, האקדמיה הציעה מסלולי לימוד לחרדים בהפרדה בין גברים ונשים. עם השנים הדרישה להפרדה מתרחבת, ועל כך מוחים ארגוני הנשים בשל הזליגה של ההפרדה למרחבי הקמפוס ובעיקר למצב של אפליה בתעסוקת נשים מכיוון שהסטודנטים החרדים מסרבים ללמוד אצל מרצות ובכך פוגעים בהעסקה שלהן ומביאים להדרת נשים. קולך הצטרפה לעתירה אשר נידונה במשך מספר שנים, וב 13 ביולי 2021, פסק בגץ כי ההפרדה תהיה מידתית: הכיר בזכותם של החרדים ללמוד באופן שלא מאיים על אורחות חייהם, לטובת הערך החשוב של שילובם בתעסוקה, אבל אסר על הדרת המרצות ובנוסף סייג את ההפרדה בתארים מתקדמים. הפסיקה הזו התקבלה כפסיקה מידתית שלוקחת בחשבון את צרכי החרדים וגם מונעת אפליית נשים.